Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vamp7P70280 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vamp7P70280 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms