Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chl1P70232 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chl1P70232 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chl1P70232 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chl1P70232 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chl1P70232 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chl1P70232 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Chl1P70232 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chl1P70232 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chl1P70232 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chl1P70232 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chl1P70232 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Chl1P70232 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chl1P70232 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Chl1P70232 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chl1P70232 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chl1P70232 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chl1P70232 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.3 ms