Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms