Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtnP63089 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtnP63089 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtnP63089 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtnP63089 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtnP63089 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtnP63089 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtnP63089 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtnP63089 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PtnP63089 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtnP63089 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtnP63089 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtnP63089 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtnP63089 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtnP63089 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtnP63089 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtnP63089 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtnP63089 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PtnP63089 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtnP63089 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtnP63089 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtnP63089 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PtnP63089 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtnP63089 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtnP63089 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtnP63089 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtnP63089 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtnP63089 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtnP63089 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtnP63089 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtnP63089 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtnP63089 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtnP63089 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtnP63089 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtnP63089 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtnP63089 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtnP63089 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtnP63089 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtnP63089 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtnP63089 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtnP63089 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtnP63089 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtnP63089 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtnP63089 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtnP63089 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtnP63089 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtnP63089 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PtnP63089 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtnP63089 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtnP63089 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtnP63089 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtnP63089 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtnP63089 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtnP63089 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtnP63089 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtnP63089 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtnP63089 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtnP63089 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtnP63089 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtnP63089 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtnP63089 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtnP63089 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtnP63089 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtnP63089 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtnP63089 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtnP63089 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtnP63089 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtnP63089 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtnP63089 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtnP63089 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtnP63089 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtnP63089 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtnP63089 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtnP63089 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtnP63089 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtnP63089 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtnP63089 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtnP63089 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtnP63089 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtnP63089 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtnP63089 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtnP63089 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtnP63089 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtnP63089 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtnP63089 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtnP63089 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PtnP63089 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtnP63089 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtnP63089 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtnP63089 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtnP63089 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtnP63089 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtnP63089 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtnP63089 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtnP63089 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtnP63089 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtnP63089 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtnP63089 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PtnP63089 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtnP63089 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms