Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps3P62908 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps3P62908 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps3P62908 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rps3P62908 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps3P62908 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps3P62908 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps3P62908 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps3P62908 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps3P62908 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps3P62908 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps3P62908 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps3P62908 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms