Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps29P62274 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps29P62274 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps29P62274 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps29P62274 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps29P62274 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rps29P62274 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rps29P62274 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rps29P62274 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps29P62274 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps29P62274 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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