Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ufm1P61961 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ufm1P61961 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms