Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga11P61622 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga11P61622 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga11P61622 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga11P61622 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga11P61622 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Itga11P61622 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Itga11P61622 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms