Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d1P61080 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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