Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setd4P58467 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setd4P58467 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setd4P58467 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setd4P58467 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Setd4P58467 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Setd4P58467 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Setd4P58467 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Setd4P58467 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Setd4P58467 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Setd4P58467 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Setd4P58467 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Setd4P58467 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Setd4P58467 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Setd4P58467 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Setd4P58467 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Setd4P58467 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Setd4P58467 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Setd4P58467 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Setd4P58467 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Setd4P58467 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Setd4P58467 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Setd4P58467 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Setd4P58467 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Setd4P58467 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Setd4P58467 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Setd4P58467 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Setd4P58467 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Setd4P58467 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Setd4P58467 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Setd4P58467 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Setd4P58467 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Setd4P58467 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Setd4P58467 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Setd4P58467 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Setd4P58467 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Setd4P58467 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Setd4P58467 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Setd4P58467 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Setd4P58467 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Setd4P58467 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Setd4P58467 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Setd4P58467 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Setd4P58467 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Setd4P58467 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Setd4P58467 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Setd4P58467 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Setd4P58467 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Setd4P58467 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Setd4P58467 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Setd4P58467 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Setd4P58467 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Setd4P58467 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Setd4P58467 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Setd4P58467 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Setd4P58467 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Setd4P58467 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Setd4P58467 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Setd4P58467 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Setd4P58467 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Setd4P58467 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Setd4P58467 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Setd4P58467 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Setd4P58467 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Setd4P58467 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Setd4P58467 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Setd4P58467 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Setd4P58467 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Setd4P58467 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Setd4P58467 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Setd4P58467 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Setd4P58467 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Setd4P58467 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Setd4P58467 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Setd4P58467 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Setd4P58467 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Setd4P58467 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms