Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrp1P56183 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms