Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HpdP49429 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HpdP49429 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HpdP49429 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HpdP49429 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HpdP49429 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HpdP49429 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HpdP49429 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HpdP49429 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HpdP49429 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HpdP49429 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HpdP49429 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HpdP49429 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HpdP49429 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HpdP49429 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HpdP49429 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HpdP49429 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HpdP49429 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HpdP49429 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HpdP49429 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HpdP49429 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HpdP49429 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HpdP49429 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HpdP49429 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HpdP49429 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HpdP49429 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HpdP49429 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HpdP49429 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HpdP49429 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HpdP49429 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HpdP49429 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HpdP49429 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HpdP49429 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HpdP49429 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HpdP49429 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HpdP49429 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HpdP49429 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HpdP49429 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HpdP49429 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HpdP49429 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HpdP49429 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HpdP49429 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HpdP49429 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HpdP49429 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HpdP49429 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HpdP49429 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HpdP49429 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HpdP49429 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HpdP49429 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HpdP49429 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HpdP49429 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HpdP49429 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HpdP49429 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HpdP49429 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HpdP49429 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HpdP49429 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HpdP49429 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HpdP49429 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HpdP49429 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HpdP49429 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HpdP49429 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HpdP49429 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HpdP49429 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HpdP49429 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HpdP49429 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HpdP49429 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HpdP49429 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HpdP49429 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HpdP49429 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HpdP49429 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HpdP49429 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HpdP49429 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HpdP49429 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HpdP49429 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HpdP49429 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HpdP49429 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HpdP49429 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HpdP49429 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HpdP49429 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HpdP49429 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HpdP49429 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HpdP49429 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HpdP49429 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HpdP49429 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HpdP49429 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HpdP49429 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HpdP49429 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HpdP49429 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HpdP49429 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HpdP49429 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HpdP49429 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HpdP49429 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HpdP49429 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HpdP49429 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HpdP49429 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HpdP49429 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HpdP49429 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HpdP49429 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HpdP49429 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HpdP49429 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms