Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VdrP48281 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VdrP48281 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VdrP48281 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VdrP48281 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VdrP48281 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VdrP48281 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VdrP48281 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VdrP48281 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VdrP48281 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VdrP48281 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VdrP48281 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VdrP48281 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VdrP48281 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VdrP48281 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
VdrP48281 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VdrP48281 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VdrP48281 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VdrP48281 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VdrP48281 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VdrP48281 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VdrP48281 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VdrP48281 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VdrP48281 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VdrP48281 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VdrP48281 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VdrP48281 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VdrP48281 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VdrP48281 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VdrP48281 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VdrP48281 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VdrP48281 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VdrP48281 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VdrP48281 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VdrP48281 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VdrP48281 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VdrP48281 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VdrP48281 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VdrP48281 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VdrP48281 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VdrP48281 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VdrP48281 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VdrP48281 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VdrP48281 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
VdrP48281 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VdrP48281 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VdrP48281 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VdrP48281 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VdrP48281 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VdrP48281 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VdrP48281 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VdrP48281 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VdrP48281 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VdrP48281 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VdrP48281 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VdrP48281 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VdrP48281 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VdrP48281 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
VdrP48281 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
VdrP48281 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
VdrP48281 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
VdrP48281 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VdrP48281 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VdrP48281 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VdrP48281 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VdrP48281 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VdrP48281 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VdrP48281 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VdrP48281 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VdrP48281 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VdrP48281 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
VdrP48281 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VdrP48281 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VdrP48281 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VdrP48281 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VdrP48281 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VdrP48281 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VdrP48281 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VdrP48281 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VdrP48281 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VdrP48281 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VdrP48281 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VdrP48281 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VdrP48281 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VdrP48281 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VdrP48281 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VdrP48281 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VdrP48281 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VdrP48281 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VdrP48281 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VdrP48281 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VdrP48281 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VdrP48281 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VdrP48281 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VdrP48281 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VdrP48281 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VdrP48281 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VdrP48281 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VdrP48281 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VdrP48281 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms