Protein–RNA interactions for Protein: P47915

Rpl29, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl29P47915 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl29P47915 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl29P47915 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl29P47915 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl29P47915 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl29P47915 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl29P47915 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl29P47915 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl29P47915 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl29P47915 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl29P47915 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl29P47915 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl29P47915 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl29P47915 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rpl29P47915 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl29P47915 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms