Protein–RNA interactions for Protein: P43352

Rad52, DNA repair protein RAD52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad52P43352 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad52P43352 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad52P43352 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad52P43352 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad52P43352 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad52P43352 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad52P43352 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad52P43352 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad52P43352 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad52P43352 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad52P43352 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad52P43352 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms