Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tlx1P43345 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms