Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms