Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nedd1P33215 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms