Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc11P31313 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms