Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NapbP28663 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NapbP28663 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NapbP28663 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NapbP28663 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NapbP28663 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NapbP28663 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NapbP28663 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NapbP28663 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NapbP28663 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NapbP28663 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NapbP28663 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NapbP28663 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NapbP28663 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NapbP28663 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NapbP28663 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NapbP28663 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NapbP28663 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NapbP28663 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NapbP28663 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NapbP28663 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NapbP28663 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NapbP28663 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NapbP28663 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NapbP28663 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NapbP28663 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NapbP28663 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NapbP28663 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NapbP28663 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NapbP28663 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NapbP28663 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NapbP28663 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NapbP28663 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NapbP28663 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NapbP28663 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NapbP28663 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NapbP28663 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NapbP28663 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NapbP28663 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NapbP28663 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NapbP28663 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NapbP28663 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NapbP28663 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NapbP28663 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NapbP28663 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NapbP28663 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NapbP28663 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NapbP28663 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NapbP28663 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NapbP28663 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NapbP28663 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NapbP28663 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NapbP28663 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NapbP28663 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NapbP28663 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NapbP28663 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NapbP28663 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NapbP28663 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NapbP28663 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NapbP28663 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NapbP28663 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NapbP28663 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NapbP28663 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NapbP28663 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NapbP28663 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NapbP28663 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NapbP28663 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NapbP28663 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NapbP28663 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NapbP28663 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NapbP28663 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NapbP28663 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NapbP28663 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NapbP28663 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NapbP28663 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NapbP28663 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NapbP28663 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NapbP28663 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NapbP28663 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NapbP28663 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NapbP28663 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NapbP28663 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NapbP28663 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NapbP28663 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NapbP28663 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NapbP28663 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NapbP28663 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NapbP28663 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NapbP28663 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NapbP28663 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NapbP28663 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NapbP28663 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NapbP28663 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NapbP28663 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NapbP28663 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NapbP28663 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NapbP28663 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NapbP28663 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NapbP28663 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NapbP28663 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms