Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdk11bP24788 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdk11bP24788 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms