Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd3eP22646 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd3eP22646 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd3eP22646 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd3eP22646 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd3eP22646 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd3eP22646 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd3eP22646 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd3eP22646 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd3eP22646 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms