Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra6P16305 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms