Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp53P15975 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp53P15975 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp53P15975 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp53P15975 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp53P15975 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp53P15975 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp53P15975 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp53P15975 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp53P15975 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp53P15975 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms