Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Myod1P10085 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myod1P10085 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myod1P10085 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Myod1P10085 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Myod1P10085 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Myod1P10085 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Myod1P10085 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms