Protein–RNA interactions for Protein: P0C872

Jmjd7, JmjC domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd7P0C872 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Jmjd7P0C872 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Jmjd7P0C872 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Jmjd7P0C872 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Jmjd7P0C872 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Jmjd7P0C872 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Jmjd7P0C872 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Jmjd7P0C872 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Jmjd7P0C872 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Jmjd7P0C872 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Jmjd7P0C872 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Jmjd7P0C872 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Jmjd7P0C872 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Jmjd7P0C872 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Jmjd7P0C872 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Jmjd7P0C872 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Jmjd7P0C872 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Jmjd7P0C872 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Jmjd7P0C872 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Jmjd7P0C872 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Jmjd7P0C872 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Jmjd7P0C872 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Jmjd7P0C872 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Jmjd7P0C872 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Jmjd7P0C872 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Jmjd7P0C872 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Jmjd7P0C872 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Jmjd7P0C872 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Jmjd7P0C872 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Jmjd7P0C872 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Jmjd7P0C872 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Jmjd7P0C872 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Jmjd7P0C872 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Jmjd7P0C872 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms