Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col3a1P08121 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col3a1P08121 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms