Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Egr1P08046 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Egr1P08046 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Egr1P08046 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Egr1P08046 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Egr1P08046 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Egr1P08046 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Egr1P08046 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Egr1P08046 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Egr1P08046 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Egr1P08046 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Egr1P08046 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Egr1P08046 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms