Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgamP05555 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgamP05555 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgamP05555 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgamP05555 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgamP05555 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms