Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04212 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04212 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04212 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04212 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04212 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04212 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04212 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04212 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04212 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04212 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04212 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P04212 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04212 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04212 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04212 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04212 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04212 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04212 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04212 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04212 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04212 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04212 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P04212 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04212 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04212 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04212 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04212 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04212 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04212 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04212 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04212 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04212 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04212 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04212 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04212 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04212 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04212 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04212 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04212 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P04212 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04212 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04212 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04212 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04212 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04212 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04212 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04212 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04212 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04212 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04212 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04212 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P04212 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04212 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04212 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04212 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04212 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04212 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04212 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04212 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04212 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04212 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04212 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04212 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P04212 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04212 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04212 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04212 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04212 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04212 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04212 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04212 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04212 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04212 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04212 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04212 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04212 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04212 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04212 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04212 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04212 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04212 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04212 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04212 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04212 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04212 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04212 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04212 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04212 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04212 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04212 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04212 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04212 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04212 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04212 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04212 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04212 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04212 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04212 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04212 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms