Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-K1P01901 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-K1P01901 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-K1P01901 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-K1P01901 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-K1P01901 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-K1P01901 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-K1P01901 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-K1P01901 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-K1P01901 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-K1P01901 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-K1P01901 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-K1P01901 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-K1P01901 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-K1P01901 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-K1P01901 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-K1P01901 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-K1P01901 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-K1P01901 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-K1P01901 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-K1P01901 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-K1P01901 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-K1P01901 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-K1P01901 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-K1P01901 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-K1P01901 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms