Protein–RNA interactions for Protein: P01680

Ig kappa chain V-IV region S107B, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01680 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01680 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01680 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01680 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01680 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01680 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
P01680 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01680 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01680 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01680 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01680 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01680 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01680 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01680 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01680 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01680 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01680 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01680 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01680 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01680 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01680 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01680 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01680 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01680 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01680 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01680 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01680 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01680 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01680 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01680 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01680 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01680 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01680 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01680 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01680 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01680 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01680 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01680 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01680 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
P01680 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01680 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
P01680 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01680 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
P01680 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01680 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01680 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01680 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01680 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01680 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01680 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01680 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01680 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01680 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01680 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01680 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01680 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01680 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01680 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01680 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01680 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01680 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01680 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01680 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01680 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01680 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01680 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01680 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01680 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01680 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01680 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01680 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01680 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01680 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01680 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01680 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01680 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01680 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01680 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01680 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01680 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
P01680 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01680 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01680 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01680 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01680 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01680 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
P01680 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01680 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01680 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01680 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01680 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01680 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01680 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01680 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01680 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01680 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01680 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01680 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01680 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01680 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms