Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01667 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01667 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01667 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01667 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01667 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01667 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01667 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01667 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01667 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01667 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01667 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01667 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01667 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01667 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01667 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01667 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01667 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01667 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01667 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01667 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01667 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01667 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01667 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01667 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01667 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01667 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01667 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01667 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01667 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01667 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01667 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01667 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01667 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01667 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01667 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01667 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01667 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
P01667 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01667 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01667 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01667 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01667 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01667 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
P01667 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01667 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01667 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
P01667 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01667 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01667 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01667 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01667 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01667 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01667 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01667 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01667 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01667 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01667 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01667 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01667 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01667 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01667 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01667 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
P01667 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01667 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01667 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01667 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01667 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01667 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01667 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01667 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01667 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01667 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01667 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01667 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01667 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01667 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01667 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01667 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01667 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01667 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01667 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01667 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01667 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01667 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01667 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01667 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01667 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01667 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01667 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01667 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01667 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01667 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01667 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01667 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01667 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01667 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01667 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01667 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01667 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.8 ms