Protein–RNA interactions for Protein: P01660

Ig kappa chain V-III region PC 3741/TEPC 111, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01660 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01660 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01660 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01660 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01660 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01660 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01660 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01660 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01660 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01660 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01660 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01660 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01660 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01660 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01660 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01660 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01660 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01660 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01660 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01660 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01660 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01660 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01660 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01660 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01660 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01660 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01660 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01660 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01660 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01660 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01660 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01660 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01660 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01660 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01660 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01660 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01660 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01660 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01660 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01660 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01660 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01660 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01660 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01660 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01660 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01660 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01660 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01660 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01660 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01660 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01660 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01660 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01660 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01660 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01660 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01660 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01660 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01660 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01660 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01660 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01660 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01660 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01660 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01660 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01660 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01660 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01660 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01660 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01660 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01660 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01660 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01660 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01660 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01660 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01660 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01660 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01660 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01660 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01660 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01660 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01660 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01660 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01660 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01660 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01660 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01660 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01660 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01660 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01660 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01660 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01660 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01660 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01660 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01660 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01660 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01660 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01660 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01660 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01660 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01660 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms