Protein–RNA interactions for Protein: P00687

Amy1, Alpha-amylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amy1P00687 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amy1P00687 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amy1P00687 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Amy1P00687 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Amy1P00687 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Amy1P00687 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Amy1P00687 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amy1P00687 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amy1P00687 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amy1P00687 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Amy1P00687 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amy1P00687 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amy1P00687 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amy1P00687 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms