Protein–RNA interactions for Protein: O88783

F5, Coagulation factor V, mousemouse

Predictions only

Length 2,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F5O88783 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F5O88783 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F5O88783 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F5O88783 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F5O88783 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F5O88783 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F5O88783 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F5O88783 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F5O88783 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F5O88783 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F5O88783 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F5O88783 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F5O88783 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F5O88783 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F5O88783 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F5O88783 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
F5O88783 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
F5O88783 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
F5O88783 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F5O88783 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F5O88783 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
F5O88783 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F5O88783 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F5O88783 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F5O88783 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F5O88783 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F5O88783 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F5O88783 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
F5O88783 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F5O88783 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
F5O88783 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F5O88783 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F5O88783 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
F5O88783 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
F5O88783 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F5O88783 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
F5O88783 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F5O88783 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F5O88783 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
F5O88783 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F5O88783 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
F5O88783 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F5O88783 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F5O88783 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
F5O88783 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F5O88783 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
F5O88783 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F5O88783 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
F5O88783 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F5O88783 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F5O88783 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F5O88783 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F5O88783 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F5O88783 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
F5O88783 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
F5O88783 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F5O88783 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F5O88783 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F5O88783 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F5O88783 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F5O88783 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F5O88783 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F5O88783 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F5O88783 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F5O88783 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F5O88783 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F5O88783 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F5O88783 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F5O88783 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F5O88783 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F5O88783 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F5O88783 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F5O88783 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F5O88783 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
F5O88783 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F5O88783 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
F5O88783 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
F5O88783 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
F5O88783 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F5O88783 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F5O88783 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
F5O88783 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
F5O88783 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
F5O88783 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F5O88783 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F5O88783 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F5O88783 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F5O88783 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F5O88783 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F5O88783 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F5O88783 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
F5O88783 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F5O88783 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F5O88783 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F5O88783 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F5O88783 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F5O88783 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
F5O88783 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F5O88783 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
F5O88783 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms