Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tom1O88746 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Tom1O88746 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tom1O88746 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tom1O88746 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tom1O88746 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tom1O88746 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tom1O88746 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tom1O88746 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Tom1O88746 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tom1O88746 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Tom1O88746 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tom1O88746 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tom1O88746 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tom1O88746 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tom1O88746 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tom1O88746 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tom1O88746 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tom1O88746 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tom1O88746 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tom1O88746 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tom1O88746 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tom1O88746 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tom1O88746 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tom1O88746 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tom1O88746 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tom1O88746 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tom1O88746 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tom1O88746 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tom1O88746 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tom1O88746 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tom1O88746 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tom1O88746 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Tom1O88746 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tom1O88746 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tom1O88746 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Tom1O88746 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tom1O88746 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tom1O88746 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms