Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BlmO88700 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
BlmO88700 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BlmO88700 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BlmO88700 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BlmO88700 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BlmO88700 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BlmO88700 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
BlmO88700 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BlmO88700 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BlmO88700 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BlmO88700 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BlmO88700 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BlmO88700 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
BlmO88700 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BlmO88700 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BlmO88700 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BlmO88700 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BlmO88700 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
BlmO88700 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BlmO88700 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BlmO88700 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BlmO88700 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BlmO88700 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BlmO88700 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BlmO88700 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
BlmO88700 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
BlmO88700 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
BlmO88700 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
BlmO88700 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
BlmO88700 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
BlmO88700 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
BlmO88700 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
BlmO88700 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
BlmO88700 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BlmO88700 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BlmO88700 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
BlmO88700 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BlmO88700 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BlmO88700 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BlmO88700 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BlmO88700 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BlmO88700 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BlmO88700 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BlmO88700 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BlmO88700 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BlmO88700 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BlmO88700 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BlmO88700 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BlmO88700 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BlmO88700 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
BlmO88700 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
BlmO88700 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BlmO88700 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BlmO88700 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BlmO88700 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BlmO88700 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BlmO88700 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
BlmO88700 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
BlmO88700 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
BlmO88700 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BlmO88700 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BlmO88700 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BlmO88700 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BlmO88700 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BlmO88700 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BlmO88700 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BlmO88700 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
BlmO88700 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BlmO88700 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BlmO88700 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BlmO88700 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BlmO88700 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BlmO88700 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BlmO88700 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BlmO88700 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BlmO88700 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BlmO88700 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BlmO88700 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BlmO88700 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BlmO88700 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BlmO88700 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BlmO88700 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BlmO88700 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BlmO88700 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BlmO88700 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BlmO88700 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BlmO88700 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BlmO88700 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BlmO88700 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BlmO88700 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BlmO88700 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BlmO88700 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BlmO88700 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BlmO88700 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BlmO88700 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BlmO88700 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BlmO88700 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BlmO88700 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
BlmO88700 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms