Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnnt1O88346 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tnnt1O88346 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
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