Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PrxO55103 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PrxO55103 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PrxO55103 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PrxO55103 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PrxO55103 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PrxO55103 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PrxO55103 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PrxO55103 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PrxO55103 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PrxO55103 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PrxO55103 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PrxO55103 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PrxO55103 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PrxO55103 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PrxO55103 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PrxO55103 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PrxO55103 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PrxO55103 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PrxO55103 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PrxO55103 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PrxO55103 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PrxO55103 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PrxO55103 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PrxO55103 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PrxO55103 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PrxO55103 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PrxO55103 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PrxO55103 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PrxO55103 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PrxO55103 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PrxO55103 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PrxO55103 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PrxO55103 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PrxO55103 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PrxO55103 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PrxO55103 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PrxO55103 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PrxO55103 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PrxO55103 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PrxO55103 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PrxO55103 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PrxO55103 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PrxO55103 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PrxO55103 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PrxO55103 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PrxO55103 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PrxO55103 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PrxO55103 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PrxO55103 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PrxO55103 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PrxO55103 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PrxO55103 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PrxO55103 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PrxO55103 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PrxO55103 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
PrxO55103 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PrxO55103 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PrxO55103 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PrxO55103 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PrxO55103 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PrxO55103 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PrxO55103 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PrxO55103 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PrxO55103 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PrxO55103 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PrxO55103 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PrxO55103 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PrxO55103 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PrxO55103 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PrxO55103 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PrxO55103 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PrxO55103 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PrxO55103 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PrxO55103 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PrxO55103 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PrxO55103 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PrxO55103 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PrxO55103 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PrxO55103 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PrxO55103 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PrxO55103 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PrxO55103 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PrxO55103 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PrxO55103 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PrxO55103 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PrxO55103 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PrxO55103 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PrxO55103 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PrxO55103 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PrxO55103 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PrxO55103 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PrxO55103 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PrxO55103 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PrxO55103 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PrxO55103 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PrxO55103 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PrxO55103 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PrxO55103 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PrxO55103 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms