Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc3O55013 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc3O55013 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms