Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bnip3O55003 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bnip3O55003 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bnip3O55003 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Bnip3O55003 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bnip3O55003 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bnip3O55003 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bnip3O55003 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bnip3O55003 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bnip3O55003 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bnip3O55003 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bnip3O55003 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bnip3O55003 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bnip3O55003 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bnip3O55003 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bnip3O55003 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bnip3O55003 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bnip3O55003 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bnip3O55003 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bnip3O55003 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Bnip3O55003 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bnip3O55003 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bnip3O55003 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bnip3O55003 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bnip3O55003 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bnip3O55003 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bnip3O55003 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bnip3O55003 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bnip3O55003 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bnip3O55003 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bnip3O55003 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bnip3O55003 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Bnip3O55003 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Bnip3O55003 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms