Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TsksO54887 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TsksO54887 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TsksO54887 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TsksO54887 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TsksO54887 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TsksO54887 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TsksO54887 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TsksO54887 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TsksO54887 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TsksO54887 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TsksO54887 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TsksO54887 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TsksO54887 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TsksO54887 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TsksO54887 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TsksO54887 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TsksO54887 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TsksO54887 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TsksO54887 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TsksO54887 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TsksO54887 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TsksO54887 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TsksO54887 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TsksO54887 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TsksO54887 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TsksO54887 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TsksO54887 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TsksO54887 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TsksO54887 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TsksO54887 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TsksO54887 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TsksO54887 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TsksO54887 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TsksO54887 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TsksO54887 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TsksO54887 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TsksO54887 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TsksO54887 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TsksO54887 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TsksO54887 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TsksO54887 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TsksO54887 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TsksO54887 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TsksO54887 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TsksO54887 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TsksO54887 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TsksO54887 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TsksO54887 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TsksO54887 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TsksO54887 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TsksO54887 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TsksO54887 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TsksO54887 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TsksO54887 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TsksO54887 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TsksO54887 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TsksO54887 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TsksO54887 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TsksO54887 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TsksO54887 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TsksO54887 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TsksO54887 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TsksO54887 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TsksO54887 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TsksO54887 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TsksO54887 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TsksO54887 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TsksO54887 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TsksO54887 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TsksO54887 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TsksO54887 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TsksO54887 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TsksO54887 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TsksO54887 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TsksO54887 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TsksO54887 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TsksO54887 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TsksO54887 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TsksO54887 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TsksO54887 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TsksO54887 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TsksO54887 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TsksO54887 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TsksO54887 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TsksO54887 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TsksO54887 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TsksO54887 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TsksO54887 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TsksO54887 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TsksO54887 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TsksO54887 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TsksO54887 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TsksO54887 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TsksO54887 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TsksO54887 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TsksO54887 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TsksO54887 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TsksO54887 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TsksO54887 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms