Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema6aO35464 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema6aO35464 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms