Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Abcc1O35379 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Abcc1O35379 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Abcc1O35379 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Abcc1O35379 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Abcc1O35379 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Abcc1O35379 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Abcc1O35379 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Abcc1O35379 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Abcc1O35379 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Abcc1O35379 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Abcc1O35379 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Abcc1O35379 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Abcc1O35379 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Abcc1O35379 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Abcc1O35379 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Abcc1O35379 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms