Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc18a3O35304 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc18a3O35304 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc18a3O35304 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc18a3O35304 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc18a3O35304 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc18a3O35304 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc18a3O35304 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc18a3O35304 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc18a3O35304 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc18a3O35304 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc18a3O35304 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc18a3O35304 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Slc18a3O35304 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms