Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.56■■■□□ 2
Pkd2O35245 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pkd2O35245 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pkd2O35245 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Pkd2O35245 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Pkd2O35245 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pkd2O35245 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Pkd2O35245 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Pkd2O35245 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pkd2O35245 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pkd2O35245 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.55■■■□□ 2
Pkd2O35245 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Pkd2O35245 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pkd2O35245 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Pkd2O35245 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pkd2O35245 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pkd2O35245 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Pkd2O35245 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pkd2O35245 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pkd2O35245 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pkd2O35245 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pkd2O35245 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pkd2O35245 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pkd2O35245 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pkd2O35245 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pkd2O35245 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pkd2O35245 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pkd2O35245 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pkd2O35245 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pkd2O35245 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pkd2O35245 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pkd2O35245 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pkd2O35245 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Pkd2O35245 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pkd2O35245 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms