Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhe40O35185 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bhlhe40O35185 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhe40O35185 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhe40O35185 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhe40O35185 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhe40O35185 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhe40O35185 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhe40O35185 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhe40O35185 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhe40O35185 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms