Protein–RNA interactions for Protein: O08917

Flot1, Flotillin-1, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flot1O08917 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Flot1O08917 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Flot1O08917 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Flot1O08917 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Flot1O08917 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Flot1O08917 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Flot1O08917 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Flot1O08917 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Flot1O08917 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Flot1O08917 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Flot1O08917 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Flot1O08917 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Flot1O08917 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Flot1O08917 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Flot1O08917 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Flot1O08917 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Flot1O08917 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Flot1O08917 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Flot1O08917 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Flot1O08917 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Flot1O08917 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Flot1O08917 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Flot1O08917 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Flot1O08917 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Flot1O08917 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Flot1O08917 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Flot1O08917 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Flot1O08917 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Flot1O08917 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Flot1O08917 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Flot1O08917 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Flot1O08917 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms