Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp35M0QWN7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Usp35M0QWN7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Usp35M0QWN7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Usp35M0QWN7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Usp35M0QWN7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Usp35M0QWN7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Usp35M0QWN7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Usp35M0QWN7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Usp35M0QWN7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp35M0QWN7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp35M0QWN7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp35M0QWN7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp35M0QWN7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp35M0QWN7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp35M0QWN7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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